Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb1P09055 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms