Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NeflP08551 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NeflP08551 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NeflP08551 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NeflP08551 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NeflP08551 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NeflP08551 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NeflP08551 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NeflP08551 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NeflP08551 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NeflP08551 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NeflP08551 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NeflP08551 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NeflP08551 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NeflP08551 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NeflP08551 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NeflP08551 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NeflP08551 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NeflP08551 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NeflP08551 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NeflP08551 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NeflP08551 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NeflP08551 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NeflP08551 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NeflP08551 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NeflP08551 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NeflP08551 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NeflP08551 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NeflP08551 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NeflP08551 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NeflP08551 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NeflP08551 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NeflP08551 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NeflP08551 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NeflP08551 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NeflP08551 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NeflP08551 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NeflP08551 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NeflP08551 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NeflP08551 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NeflP08551 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeflP08551 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeflP08551 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeflP08551 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeflP08551 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeflP08551 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeflP08551 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeflP08551 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeflP08551 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeflP08551 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeflP08551 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeflP08551 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NeflP08551 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NeflP08551 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NeflP08551 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NeflP08551 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NeflP08551 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NeflP08551 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NeflP08551 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NeflP08551 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NeflP08551 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NeflP08551 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NeflP08551 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NeflP08551 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NeflP08551 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NeflP08551 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NeflP08551 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NeflP08551 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NeflP08551 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NeflP08551 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NeflP08551 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NeflP08551 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NeflP08551 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NeflP08551 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NeflP08551 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NeflP08551 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NeflP08551 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NeflP08551 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NeflP08551 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NeflP08551 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NeflP08551 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NeflP08551 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NeflP08551 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NeflP08551 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NeflP08551 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NeflP08551 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NeflP08551 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NeflP08551 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NeflP08551 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NeflP08551 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NeflP08551 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NeflP08551 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NeflP08551 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NeflP08551 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NeflP08551 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NeflP08551 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NeflP08551 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NeflP08551 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NeflP08551 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NeflP08551 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms