Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-AaP01910 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-AaP01910 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-AaP01910 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-AaP01910 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-AaP01910 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-AaP01910 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-AaP01910 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-AaP01910 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms