Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01791 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01791 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01791 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01791 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01791 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01791 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01791 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01791 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01791 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01791 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01791 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01791 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01791 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01791 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01791 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01791 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01791 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01791 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01791 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01791 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01791 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01791 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01791 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01791 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01791 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01791 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01791 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01791 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01791 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01791 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01791 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01791 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01791 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01791 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01791 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01791 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01791 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01791 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01791 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01791 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01791 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01791 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01791 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01791 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01791 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms