Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01790 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01790 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01790 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01790 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01790 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01790 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01790 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01790 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01790 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01790 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01790 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01790 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01790 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01790 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01790 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01790 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01790 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01790 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01790 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01790 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01790 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01790 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01790 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01790 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01790 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01790 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01790 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01790 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01790 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01790 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01790 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01790 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01790 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01790 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01790 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01790 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01790 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01790 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01790 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01790 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01790 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01790 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01790 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01790 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01790 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01790 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01790 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01790 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01790 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01790 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01790 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01790 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01790 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01790 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms