Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01748 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01748 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01748 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01748 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01748 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01748 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01748 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01748 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01748 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01748 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01748 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01748 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01748 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01748 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01748 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01748 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01748 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01748 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01748 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01748 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01748 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01748 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01748 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01748 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01748 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01748 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01748 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01748 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01748 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01748 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01748 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01748 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01748 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01748 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01748 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01748 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01748 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01748 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01748 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01748 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01748 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01748 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01748 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01748 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01748 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01748 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01748 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01748 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01748 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01748 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms