Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01747 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01747 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01747 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01747 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01747 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01747 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01747 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01747 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01747 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01747 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01747 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01747 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01747 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01747 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01747 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01747 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01747 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01747 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01747 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01747 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01747 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01747 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01747 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01747 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01747 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01747 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01747 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01747 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01747 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01747 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01747 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01747 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01747 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01747 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms