Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01728 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01728 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01728 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01728 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01728 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01728 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01728 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01728 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01728 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01728 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01728 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01728 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01728 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01728 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01728 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01728 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01728 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01728 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01728 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01728 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01728 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01728 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01728 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01728 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01728 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01728 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01728 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01728 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01728 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01728 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01728 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01728 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01728 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01728 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01728 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01728 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01728 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01728 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01728 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01728 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01728 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01728 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01728 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01728 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01728 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01728 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms