Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vti1aO89116 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms