Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2bO89051 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itm2bO89051 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2bO89051 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms