Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn3O88990 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Actn3O88990 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn3O88990 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn3O88990 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn3O88990 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms