Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F11rO88792 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F11rO88792 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F11rO88792 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F11rO88792 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F11rO88792 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F11rO88792 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F11rO88792 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F11rO88792 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F11rO88792 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F11rO88792 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F11rO88792 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F11rO88792 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F11rO88792 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F11rO88792 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F11rO88792 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F11rO88792 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F11rO88792 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F11rO88792 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F11rO88792 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F11rO88792 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F11rO88792 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F11rO88792 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F11rO88792 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F11rO88792 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F11rO88792 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F11rO88792 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F11rO88792 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F11rO88792 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F11rO88792 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F11rO88792 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F11rO88792 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F11rO88792 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F11rO88792 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F11rO88792 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F11rO88792 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F11rO88792 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F11rO88792 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F11rO88792 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F11rO88792 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F11rO88792 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F11rO88792 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F11rO88792 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F11rO88792 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F11rO88792 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F11rO88792 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F11rO88792 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F11rO88792 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F11rO88792 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F11rO88792 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F11rO88792 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F11rO88792 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F11rO88792 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F11rO88792 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F11rO88792 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms