Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tom1O88746 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tom1O88746 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tom1O88746 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tom1O88746 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tom1O88746 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tom1O88746 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tom1O88746 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tom1O88746 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tom1O88746 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tom1O88746 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tom1O88746 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tom1O88746 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Tom1O88746 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tom1O88746 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tom1O88746 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tom1O88746 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tom1O88746 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tom1O88746 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tom1O88746 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tom1O88746 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms