Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pak1O88643 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pak1O88643 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pak1O88643 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pak1O88643 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pak1O88643 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pak1O88643 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pak1O88643 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms