Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3fO88632 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sema3fO88632 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms