Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap30O88574 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap30O88574 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sap30O88574 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sap30O88574 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap30O88574 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap30O88574 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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