Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnnt1O88346 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnnt1O88346 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms