Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna4O70174 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chrna4O70174 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms