Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChadO55226 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChadO55226 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChadO55226 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChadO55226 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChadO55226 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChadO55226 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChadO55226 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChadO55226 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChadO55226 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ChadO55226 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChadO55226 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChadO55226 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChadO55226 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChadO55226 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChadO55226 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChadO55226 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChadO55226 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChadO55226 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChadO55226 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChadO55226 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChadO55226 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChadO55226 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChadO55226 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChadO55226 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChadO55226 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChadO55226 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChadO55226 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChadO55226 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChadO55226 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChadO55226 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChadO55226 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChadO55226 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChadO55226 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChadO55226 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChadO55226 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChadO55226 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChadO55226 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ChadO55226 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChadO55226 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChadO55226 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ChadO55226 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChadO55226 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChadO55226 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChadO55226 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChadO55226 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChadO55226 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChadO55226 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ChadO55226 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChadO55226 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChadO55226 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms