Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cbx4O55187 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms