Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap1O55125 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap1O55125 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms