Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syngr1O55100 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms