Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb2O55029 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb2O55029 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb2O55029 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb2O55029 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb2O55029 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Copb2O55029 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Copb2O55029 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Copb2O55029 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copb2O55029 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb2O55029 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Copb2O55029 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb2O55029 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb2O55029 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb2O55029 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms