Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnk2O54967 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms