Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LatO54957 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LatO54957 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LatO54957 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LatO54957 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LatO54957 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LatO54957 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LatO54957 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LatO54957 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LatO54957 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LatO54957 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LatO54957 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LatO54957 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LatO54957 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LatO54957 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LatO54957 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LatO54957 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LatO54957 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LatO54957 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LatO54957 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LatO54957 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LatO54957 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LatO54957 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LatO54957 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LatO54957 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LatO54957 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LatO54957 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LatO54957 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LatO54957 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LatO54957 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LatO54957 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LatO54957 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LatO54957 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LatO54957 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LatO54957 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LatO54957 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LatO54957 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LatO54957 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LatO54957 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LatO54957 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LatO54957 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LatO54957 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LatO54957 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LatO54957 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LatO54957 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LatO54957 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LatO54957 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LatO54957 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LatO54957 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LatO54957 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LatO54957 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LatO54957 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LatO54957 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LatO54957 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LatO54957 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LatO54957 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LatO54957 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LatO54957 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LatO54957 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LatO54957 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LatO54957 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LatO54957 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LatO54957 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LatO54957 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms