Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrxO54751 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrxO54751 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrxO54751 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrxO54751 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrxO54751 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrxO54751 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CrxO54751 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrxO54751 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrxO54751 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrxO54751 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CrxO54751 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrxO54751 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrxO54751 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CrxO54751 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrxO54751 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CrxO54751 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CrxO54751 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CrxO54751 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CrxO54751 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CrxO54751 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CrxO54751 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxO54751 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxO54751 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxO54751 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxO54751 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxO54751 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxO54751 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxO54751 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxO54751 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrxO54751 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrxO54751 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrxO54751 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxO54751 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxO54751 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxO54751 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxO54751 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxO54751 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxO54751 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxO54751 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxO54751 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxO54751 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxO54751 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxO54751 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxO54751 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxO54751 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxO54751 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxO54751 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxO54751 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxO54751 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxO54751 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxO54751 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxO54751 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxO54751 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms