Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg3O35902 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg3O35902 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms