Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold2O35654 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold2O35654 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold2O35654 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold2O35654 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold2O35654 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pold2O35654 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pold2O35654 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold2O35654 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pold2O35654 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pold2O35654 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pold2O35654 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pold2O35654 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pold2O35654 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pold2O35654 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pold2O35654 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pold2O35654 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pold2O35654 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pold2O35654 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pold2O35654 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pold2O35654 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pold2O35654 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pold2O35654 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pold2O35654 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pold2O35654 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pold2O35654 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pold2O35654 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pold2O35654 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pold2O35654 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pold2O35654 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms