Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xbp1O35426 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xbp1O35426 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms