Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna3O35344 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna3O35344 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms