Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna4O35343 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna4O35343 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna4O35343 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms