Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf11O35235 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms