Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf2O35218 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms