Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe40O35185 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms