Protein–RNA interactions for Protein: O35084

Cyp27b1, 25-hydroxyvitamin D-1 alpha hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27b1O35084 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27b1O35084 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27b1O35084 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27b1O35084 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms