Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcshO08795 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkcshO08795 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms