Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3aO08759 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube3aO08759 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms