Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MsmbO08540 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MsmbO08540 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MsmbO08540 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MsmbO08540 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MsmbO08540 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MsmbO08540 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MsmbO08540 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MsmbO08540 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MsmbO08540 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MsmbO08540 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MsmbO08540 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MsmbO08540 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MsmbO08540 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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