Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8050L7N2E3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8050L7N2E3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms