Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm4340L7N2C4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm4340L7N2C4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm4340L7N2C4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms