Protein–RNA interactions for Protein: L7N296

Gm3739, Predicted gene 3739, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3739L7N296 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3739L7N296 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3739L7N296 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms