Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r80L7N1Z3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r80L7N1Z3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r80L7N1Z3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r80L7N1Z3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r80L7N1Z3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r80L7N1Z3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r80L7N1Z3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r80L7N1Z3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms