Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r78K7N6U5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r78K7N6U5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms