Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8298J3QPI0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8298J3QPI0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms