Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20918J3QN17 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms