Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3415J3QMS8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3415J3QMS8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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