Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm11236J3QMS7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm11236J3QMS7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm11236J3QMS7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm11236J3QMS7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm11236J3QMS7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm11236J3QMS7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm11236J3QMS7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm11236J3QMS7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm11236J3QMS7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm11236J3QMS7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm11236J3QMS7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms