Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20834J3QM72 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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