Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21820J3KMU2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm21820J3KMU2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21820J3KMU2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms