Protein–RNA interactions for Protein: H3BJG9

Ly6l, Lymphocyte antigen 6L, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6lH3BJG9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6lH3BJG9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6lH3BJG9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ly6lH3BJG9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ly6lH3BJG9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ly6lH3BJG9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms